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美科学家披露两种致命疾病详细基因畸变图谱

点击次数: 519 发布时间:2008年9月23日

    在关于重新界定如何观察、研究和治疗癌症的3项最新研究中,科学家们绘制出了一幅详细的基因突变图谱,用以深入了解2种最致命的疾病:胰腺癌和胶质母细胞瘤。这项新成果是绘制癌症基因组图这项巨大任务迈出的第一步,这将使研究人员得以从基础层面来了解癌症。

  几十年来,科学家们已经了解到,癌症的发展是导致细胞生长和分裂失控的基因变化所引起的。但是揭示每一个变化和理解这些变化如何导致疾病是一项艰巨的任务,其一就涉及对多达上百种的肿瘤,及每种肿瘤的数百个不同病人样本的测序和分析。虽然有人认为,对这些突变进行有系统的编目,对如何对抗甚至是预防癌症提供了前所未有的深入了解,但也有人认为这类研究的回报可能根本不值其高成本。最新的研究成果使人们初步看到了这些研究究竟会有什么回报。

  发表于《自然》杂志网络版上的第一项研究,得益于由公共投资的“癌症基因组图谱”(TCGA)项目所收集的数据。TCGA倡议使用大规模基因组测序来发现和绘制不同癌症基因畸变图。美国波士顿达纳—法伯癌症研究所的琳达•秦和马修•米尔森对200多个胶质母细胞瘤的基因变化(如样本中的每个蛋白编码基因的副本数量,以及甲基化过程后这些基因是否已关闭)进行了分析。他们还分析了和该疾病已有关联的600个基因。

  研究结果在3个主要基因中确认了已知的“嫌疑者”,并揭示了以前并不为人知的变化。这3个基因中的两个是已知的肿瘤抑制器(NF1和ERBB2),另一个是新发现的癌症相关基因(PIK3R1),它将有可能成为正在开发中的抗癌药物靶标。

  另两项研究则是由约翰•霍普金斯大学3名研究人员牵头的私立癌症基因组计划作出的。虽然他们分析的肿瘤类型要少得多,但分析的详细程度则非常高。发表在《科学》杂志网络版上的论文表明,他们在对22个胰腺肿瘤和24个胶质母细胞瘤的基因副本数、基因表达及它们的2万多个蛋白编码基因的每一个序列都进行了分析,结果发现每个细胞约发生了60%%的基因变化,而且这些突变的绝大多数仅在12种细胞通道中起着核心作用。

  这些通道也许将成为未来药物研发的中心。约翰•霍普金斯大学的课题组领导之一波特•沃格尔斯坦认为,针对这些核心通道进行药物筛选将会使研发效率大大提高,新药物将能对肿瘤的大部分进行有效攻击。

  约翰•霍普金斯小组的一项研究成果特别展示了全基因组方法的价值。领导霍普金斯胶质母细胞瘤研究的维克托•凡库赖斯库和同事发现,某个基因的突变情形和另一个胶质母细胞瘤患者身上发生的并不相同,而研究人员一直认为这应是十分相似的。这个基因就是IDH1,以前从未和任何癌症有过关联。IDH1突变发生在12%%的胶质母细胞瘤患者身上,这些患者的平均年龄为20岁,其存活期明显长于那些没有该基因突变的患者。

  这项发现也许是这3项研究中最具有即时临床相关性的,科学家们希望这将能尽快用来帮助医生更好地预测患者的存活期。该发现也能有助于医生确定现有疗法是否能更有效地治疗此类胶质母细胞瘤,并最终直接针对IDH1通道建立治疗方案。

  研究人员称,该研究成果首次真正明确地界定了一套胶质母细胞瘤的治疗路线图。研究人员同时希望能尽快降低测序成本,以将两种技术加以融合,从而对许多肿瘤中的大量基因进行测序。

核心关键词:癌症、基因、图谱

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——信息来源:科技日报  
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